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在过去20年，晚期头颈肿瘤患者的预后并没有得到明显改善，尽管使用常规方法如手术、放疗和化疗共同努力优化治疗方法。根据对肿瘤发生的分子变化的越来越多的理解，新的治疗方法有可能改变这种情况，基因治疗涉及到为了治疗目的将基因序列递送到肿瘤细胞或正常细胞，这些治疗基因通过修正存在的遗传异常，恢复免疫系统间接或直接杀死细胞来发挥作用。免疫基因治疗为头颈癌的治疗带来了希望。有些治疗方案已进入临床试用阶段，包括细胞因子基因治疗、肿瘤抗原靶向的基因治疗、共刺激分子基因治疗、主要组织相容性复合体靶向的基因治疗及反义基因治疗