甘蔗叶片响应褐锈病菌(Puccinia melanocephala)侵染的转录组分析

• 作 者: 高小宁 吴自林 黄咏虹 刘睿 齐永文
• 机 构: 广东省科学院生物工程研究所/广东省甘蔗遗传改良工程技术中心
• 出 处: 中国农学通报
• 发表日期: 2021年24期
• 关键词: 甘蔗 褐锈菌 亲和互作 高通量测序 转录组 差异表达基因
• 基金项目: 广东省科学院建设国内一流研究机构行动专项资金项目“甘蔗与褐锈菌互作的细胞学和转录组学分析及抗病相关基因挖掘”(2019GDASYL-0103029),广东省自然科学基金面上项目“自噬相关基因SsATG18a参与甘蔗与褐锈病互作的分子机理研究”(2021A1515011321),广东省甘蔗剑麻产业技术体系创新团队“甘蔗抗性育种岗位”(2019KJ104-05),国家糖料产业技术体系“甘蔗高糖聚合品种

旨在从转录水平分析甘蔗叶片响应褐锈病菌侵染的基因表达特征,为进一步研究甘蔗抗褐锈病的分子机理提供基础资料。本研究采用高通量测序技术Illumina Hiseq 2500对健康以及被褐锈病菌侵染的甘蔗叶片进行转录组测序,利用生物信息学方法对差异表达基因进行功能注释和分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对5个差异基因的相对表达量进行了验证。转录组数据分析共鉴定出差异表达基因4716个,其中上调表达2979个,下调表达1737个。GO注释结果显示,差异表达基因主要聚集在细胞过程、生物过程、催化活性等生