β-654地中海贫血小鼠骨髓红系终末分化的阶段特异性转录组特征

• 作 者: 史丽芳 余东林 刘雪会 吕湘
• 机 构: 中国医学科学院基础医学研究所
• 出 处: 基础医学与临床
• 发表日期: 2020年9期
• 关键词: 转录组 β-654地中海贫血 热休克蛋白 蛋白质折叠 transcriptomeβ-654 thalassemiaheat shock proteinprote
• 基金项目: 国家重点研发计划干细胞及转化研究专项(2016YFA0100603),国家自然科学基金(81670108),中国医学科学院医学与健康科技创新工程协同创新团队项目(2016-I2M-3-002)

目的探索β-654地中海贫血小鼠骨髓红系终末分化的阶段特异性转录组特点。方法对β-654地中海贫血小鼠及同窝野生对照小鼠进行基因型鉴定及外周血涂片染色分析,而后对其骨髓细胞做流式细胞分选,收集原始红、早幼红、中幼红和晚幼红细胞用于转录组测序;测序数据过滤后进行基因差异表达分析,进一步对差异基因做GO富集分析并通过STRING数据库和Cytoscape软件对其中的上调基因进行蛋白质间相互作用网络和关键基因分析。结果β-654地中海贫血小鼠骨髓红系细胞与同期正常对照间的差异基因随分化进程逐渐增多;GO分析显示