【摘 要】
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目的 了解新疆和田地区甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征.方法 收集新疆和田地区2016年甲型肝炎病例急性期血清标本,经核酸提取、逆转录、套式PCR、序列测
【机 构】
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和田地区疾病预防控制中心,新疆和田,848500;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京,102206
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目的 了解新疆和田地区甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征.方法 收集新疆和田地区2016年甲型肝炎病例急性期血清标本,经核酸提取、逆转录、套式PCR、序列测定,进行HAV基因分型、主要中和抗原位点氨基酸序列分析,并与GenBank中HAV基因型和亚型代表株构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸序列差异或同源性.结果 获得和田地区43株2016年IA基因亚型HAV流行株和2株减毒活疫苗株序列.43株流行株在VP1-2A区的核苷酸、氨基酸序列差异分别为0.0％-2.9％、0.0％-1.9％,在VP3-VP1-2A区分别为0.0％-2.2％、0.0％-0.7％;与2株减毒活疫苗株的氨基酸序列差异为0.5％-0.9％.HAV流行株的主要中和抗原位点未发现氨基酸变异,处于负向选择压力;与GenBank中中国新疆、中国四川或日本HAV序列的同源性最高.结论 2016年和田地区HAV流行株为基因IA亚型且分为不同基因簇;HAV流行株和减毒活疫苗株的主要中和抗原位点氨基酸序列保守.
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