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心理学学科的科学性及不可替代性是由心理学研究的研究方法的可靠性决定的。方法论的整体性应用体现了心理学研究的科学性及可靠性,即心理学研究的研究对象、研究方法、研究工具、研究者与研究对象的关系都应该在其哲学方法论的指导下进行选择、设计和确定。可以以"自我决定理论"视角下对行为动机的研究为例,讨论以现实批判主义作为本体论和认识论哲学基础对现象学心理学研究方法的指导意义与价值,以此对方法论在心理学领域研究的整体性应用进行论证,并对"自我决定理论"视角下对行为动机的研究设计提供方案建议。