巨桉GOLDEN2-LIKE基因家族全基因组鉴定与进化分析

• 作 者: 李丁宁 吴进樟 李白杨 曹世江
• 机 构: 福建农林大学林学院,福建农林大学植物保护学院
• 出 处: 福建农林大学学报:自然科学版
• 发表日期: 2020年6期
• 关键词: 巨桉 GOLDEN2-LIKE基因 全基因组鉴定 进化分析 Eucalyptus grandisGOLDEN2-LIKE genegenome-wide ide
• 基金项目: 福建农林大学林学高峰学科建设项目(71201800739)

利用生物信息学方法,基于全基因组水平筛选鉴定出40个巨桉GLK基因(EgG1~EgG40),对其分子质量、等电点和亲水性进行了预测.结果表明,这些基因非均匀地分布在11条染色体上,亚细胞定位主要在细胞质和细胞核上.GLK蛋白二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主.系统进化分析将巨桉GLK基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ等5个亚家族.该家族基因含有1~11个外显子,基因结构相对保守.结果表明巨桉GLK基因在成熟叶、茎尖和幼叶中表达较高,而在木质部中表达相对较低.