2型糖尿病肾病肾小球病变关键基因的生物信息学研究

来源 :中华内分泌代谢杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:b2316
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

基于生物信息学技术筛选2型糖尿病肾病(DN)肾小球病变差异表达基因,并探讨其在分子过程中可能的途径。

方法

筛选基因表达公共数据库(GEO)中DN相关基因芯片数据集GSE96804,采用R 3.6.2软件分析在DN肾小球与正常肾小球中差异表达的基因。对筛选得到的差异基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。应用蛋白-蛋白相互作用数据库(String)11.0及Cytoscape 3.7.2软件分析关键基因及其相关通路。

结果

通过生物信息学方法得到168个差异表达基因,筛选后得到7个关键基因ALB、FN1、EGF、PTGS2、PLG、KDR、LOX,其中ALB、EGF、PLG直接作用于肾小球。差异基因的GO富集分析主要表现在细胞外基质组织、细胞外结构组织、血小板脱颗粒等生物过程,细胞外基质、分泌颗粒腔、血小板α颗粒等细胞组成,分子伴侣结合、铜离子结合、抗氧化活性等分子功能。主要调控与脂肪酸降解信号通路、CYP酶相关的外源性物质代谢及药物代谢信号通路相关的代谢过程。

结论

本研究从肾小球病变的角度进行生物信息学分析,有利于了解DN发生的潜在分子机制,为进一步验证研究提供参考。

其他文献
初中阶段作为学生学习数学知识比较重要的时期,为能有效提升数学课堂教学的质量水平,这就需要在教学方法的创新方面加强重视,针对学生逻辑推理能力素质展开培养,这就需要教师
会议
由于历史社会原因,男性与女性对于空间有不同的需求,而空间又以不同的形式状态反作用于人类。权力,空间,性别的关系在《小镇畸人》与《一间自己的屋子》中显而易见,本文将以此为角
  Objective: Endoscopic lumbar discectomy has been recognize as an minimally invasive technique for lumbar disc herniation.The purpose of this study is to exp
会议
会议
亨利·布特纳尔的名字,和他的幽默漫画一起从德国走遍了世界。音乐家的生活细节,到了他的笔下,奇趣横生,异彩大放,令你看后爱不释手。 Henry Butternall’s name traveled