【摘 要】
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目的 探讨关键干细胞特性基因在卵巢癌的诊断和治疗中的意义.方法 加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选出关键模块和基因;基因集富集分析(GSEA)和单细胞测序数据分析关键
【机 构】
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四川大学华西医学院生物治疗科 成都 610041;四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室 成都 610041
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目的 探讨关键干细胞特性基因在卵巢癌的诊断和治疗中的意义.方法 加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法筛选出关键模块和基因;基因集富集分析(GSEA)和单细胞测序数据分析关键基因上调组高表达的信号通路;pRRophetic预测卵巢癌的化疗药物的敏感性;流式细胞术检测SKOV3细胞和肿瘤干细胞中CD44及CD117的表达情况;实时荧光定量(qRT)-PCR证实关键基因在卵巢癌干细胞中的表达;GeneMANIA分析鉴定出核心基因.结果 WGCNA结果显示在转录水平上筛选出15个关键基因,其在多种肿瘤中高表达,参与细胞周期、DNA修复、E2靶点和G2M检查点通路,且与化疗药物敏感性有显著的关联性.CD44+CD117+细胞在SKOV3细胞和卵巢癌干细胞中的比例分别为(1.20±0.34)％、(37.17±1.80)％,差异有统计学意义(P<0.05).qRT-PCR证实WGCNA结果中7个关键基因(BUB1、CDC20、CCNB2、DLGAP5、KIF4A、NEK2、NUSAP1)在卵巢癌干细胞中高表达,并且BUB1可能起着核心的作用.结论 本研究通过构建基因共表达网络筛选出7个干细胞特性关键基因,尤其是BUB1,可能成为潜在的卵巢癌基因生物标志物.
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