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长江入海扩散悬沙和当地岛屿风化物是崎岖列岛海区现代沉积物的主要物质来源.崎岖列岛的地形、潮流、长江冲淡水和风浪是影响列岛海区现代沉积环境的主要因素.根据沉积环境的差异可将列岛海区划分为4大沉积区:列岛区外沉积区、列岛周边沉积区、列岛峡道沉积区和峡道侧向潮汐通道沉积区.列岛区外沉积区主要受外海潮流、风浪和长江冲淡水的影响,主要沉积物为粘土.列岛峡道沉积区受峡道内强劲的往复流影响,峡道西部以粗颗粒沉积物为主,峡道东部深槽区的粘土和亚粘土沉积物应属冲刷出露出的早期沉积地层.