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细菌降解有机物又由小型浮游动物摄食回到主食物链的微食物循环被认为是海洋生态系统稳定的重要因素，是主食物链的必要补充，而对该作用的认识需要模型量化。本研究在已有黄海浮游生态系统模型基础上，增加微食物环过程（打开已有模型中营养物质转化的隐形参数关系，建立异养细菌与有机物和浮游动物之间的能量流动联系），考虑黄海营养状况，建立了1个基于磷、硅循环，包括细菌、浮游植物（小型和大型）、浮游动物（小型、大型和捕食性）生物量、磷营养盐浓度（磷酸盐、溶解态有机磷和颗粒态有机磷）及硅营养盐浓度（硅酸和生物硅）共11个生态变量