C型产气荚膜梭菌cpe基因克隆与分析

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  摘?要 参照GeneBank上产气荚膜梭菌肠毒素(cpe)基因序列,设计合成一对特异性引物,采用PCR技术对产气荚膜梭菌C型分离株进行扩增,将扩增产物连接到pMD18-T载体,转化至大肠杆菌DH5a感受态细胞,提取质粒进行PCR和双酶切鉴定后测序,结果显示:产气荚膜梭菌C型分离株cpe基因全长960bp,可编码319个氨基酸;与参考株核苷酸同源性为99.4%~99.8%,氨基酸同源性为99.1%~99.7%。
  关键词 产气荚膜梭菌;肠毒素基因;克隆;序列分析
  中图分类号 S852 文献标识码 A 文章编号 1673-9671-(2012)072-0172-02
  产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)是一种温和厌氧的梭状芽孢杆菌,广泛分布于土壤、污水、饲料、食物、人畜粪便及肠道中,能引起人类气性坏疽及多种动物肠毒血症和坏死性肠炎。产气荚膜梭菌能产生15种以上外毒素及侵袭性酶类,根据其产生的四种主要致死性毒素即α、β、ε和ι毒素的差异,可将产气荚膜梭菌分为A~E五种血清型。产气荚膜梭菌肠毒素(Clostridium perfringens enterotoxin,CPE)主要是由A型产气荚膜梭菌产生,部分C型和D型菌也可以产生,是一种对热和PH均不稳定的蛋白,分子量为35KD。据报道,仅有少数产气荚膜梭菌(约5%)带有cpe基因,并且大部分cpe阳性分离株都来自人食物中毒病例。携带CPE的A型产气荚膜梭菌是引起产气荚膜梭菌性食物中毒的主要病原,该种食物中毒数已占整个食物中毒病例总数的第二位。本试验验对产气荚膜梭菌C型cpe基因进行了克隆测序分析,以期为产气荚膜梭菌肠毒素所致疾病的诊断与控制提供一些依据。
  1 材料和方法
  1.1 菌株及载体
  含cpe基因产气荚膜梭菌A型菌株(NCTC64609)为广州市疾病预防控制中心邓志爱老师惠赠;产气荚膜梭菌C型分离株(CP2)由贵州大学文明老师惠赠;宿主菌DH5a和pMD18-T vector购自大连宝生物工程有限公司;其它试剂均为分析纯。
  1.2 主要试剂
  PCR试剂、200bp Markers、EB、酚/氯仿/异戊醇等,购自上海生物工程公司;凝胶回收试剂盒、限制性核酸内切酶(EcoRⅠ和BamHⅠ)、X-gal、IPTG、RNase等,购自大连宝生物工程有限公司;细菌培养基,购自杭州微生物试剂有限公司。
  1.3 cpe基因引物设计与合成
  参照GeneBank上产气荚膜梭菌cpe基因序列设计特异性引物P1和P2(P1:5’-TTAGGATCCATGCTTAGTAACAATTTAAATCC-3’/P2:5’-GGG GAATTCTTAAAATTTTTGAAATAATATTGA-3’, 黑斜体表示酶切位点),预期扩幅为960bp,由上海生物工程技术有限公司合成。
  1.4 菌株复苏与DNA提取
  取产气荚膜梭菌A型标准株(NCTC64609)及C型分离株分别接种厌氧肉肝汤培养基,37℃厌氧培养24 h后,取其培养物1.0 mL,8000 r/min离心5 min,弃上清,加入200 μL灭菌双蒸水,水浴加热15~20 min,8000 r/min离心5 min,取上清即为细菌DNA模板。
  1.5 cpe基因PCR扩增
  建立50 μL PCR反应体系,即10×Buffer缓冲液5.0 μL、MgCl2 (2.5 mmol/L)4.0 μL、dNTP(10 mM) 1.0 μL、模板5.0 μL和上下游引物(10 μmol/L)各2.0 μL、Taq DNA聚合酶(2.5U)1.0 μL,加灭菌双蒸水补至50 μL。PCR反应条件:94℃预变性5 min;前5个循环的扩增条件为94℃ 30 s、40℃ 30 s、72℃ 80 s,然后按94℃ 30 s、50℃ 30s、72℃ 80 s进行25个循环;72℃延伸10 min。取PCR产物8.0 μL于1.0%琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像系统观察结果。
  1.6 cpe基因回收、转化与鉴定
  采用DNA胶回收试剂盒回收PCR产物,与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌DH5a感受态细胞,经含Amp、X-gal和IPTG平板培养筛选,挑取白色菌落,在含Amp的LB液体培养基培养过夜,用SDS碱裂解法提取重组质粒,采用PCR与双酶切鉴定,筛选阳性重组质粒。
  1.7 序列测定与分析
  取阳性重组质粒送至大连宝生物公司测序,应用DNAMAN软件进行核苷酸与氨基酸序列同源性分析,Clustalx1.83和mega3软件构建cpe基因系统发生树。
  2 结果
  2.1 产气荚膜梭菌C型菌cpe基因PCR扩增结果
  经PCR检测发现,产气荚膜梭菌C型分离株可扩增出一条约960 bp大小的DNA条带,与产气荚膜梭菌A型标准株(NCTC64609)的扩增产物大小基本一致(见图1)。
  N: Blank Control;
  1: Cl. perfringens cpe Type C isolates;
  2: Cl. perfringens cpe type A (NCTC64609);
  M: 200bp Markers
  图1 产气荚膜梭菌C型cpe 基因PCR扩增结果
  2.2 含cpe基因重组质粒鉴定
  取产气荚膜梭菌C型分离株PCR产物,与pMD18-T载体连接并转化后,挑取白色菌落,过夜摇菌,提取质粒,经PCR和双酶切鉴定显示,所选菌落为阳性重组质粒(见图2)。
  2.3 cpe基因序列测定与分析
  测序显示产气荚膜梭菌C型分离株肠毒素基因全长960bp,可编码319个氨基酸。采用DNAMAN软件分析发现,产气荚膜梭菌C型分离株肠毒素基因与参考株核苷酸同源性为99.4%~99.8%,氨基酸同源性为99.1%~99.7%(见表1)。运用Clustalx1.83和mega3绘制系统发生树发现,产气荚膜梭菌C型分离株(CP2)肠毒素基因与参考株的亲缘关系均很近(见图3)。   1: The digested results of the recombinant plasmid;
  2: Control of the recombinant plasmid;
  3: PCR result of the recombinant plasmid;
  M: 200bp Markers
  图2 重组质粒鉴定结果
  图3 产气荚膜梭菌肠毒素基因系统发生树
  3 讨论与分析
  产气荚膜梭菌是一种重要的人畜共患病病原,可引起多种动物肠毒血症和坏死性肠炎,也是一种比较常见的食物中毒致病菌,广泛分布于自然界(水源、土壤等)及人和动物肠道中。肠毒素(Clostridium perfringens enterotoxin,CPE)主要由A型产气荚膜梭菌在芽孢期产生的一种毒素,部分C型和D型菌也能产生,是产气荚膜梭菌一个非常重要的致病毒素,在引起人和动物胃肠疾病方面起着关键性的作用。本研究根据cpe开放阅读框设计并合成合成1对引物,运用PCR方法进行扩增,成功克隆出了C型产气荚膜梭菌肠毒素基因,经同源性和进化树分析发现,C型产气荚膜梭菌分离株与参考株同源性达99.4%~99.8%,与参考株间亲缘关系均较近,可见cpe在产气荚膜梭菌中是相对稳定或保守的。这些研究,为产气荚膜梭菌肠毒素所致疾病的诊断与控制提供依据。
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  作者简介
  秦雯(1983—),女,汉族,助教,贵阳护理职业学院,研究方向:卫生检验与检疫技术。
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