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新疆绿洲独特的自然地理条件为其农业发展提供突出优势的同时，也使其面临严峻考验。为充分利用资源优势，发展绿洲高效生态农业，本文利用耗散结构理论对新疆绿洲生态农业系统进行了耗散结构特性及熵流分析，得出其熵流状况，并提出完善新疆绿洲生态农业系统耗散结构特性，不断向系统输入负熵流，增强系统负熵流利用效率，从而促使其远离平衡态，实现人口、资源、环境协调运作的高效发展模式。