浙江省啮齿动物中温州病毒的基因组学分析

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目的

为了解国内发现的新型沙粒病毒(温州病毒)在温州地区啮齿类动物中的流行情况。

方法

采用巢式RT-PCR方法分别对采集自温州(48份)及龙泉(156份)的啮齿动物样本筛查沙粒病毒。

结果

在温州地区采集的5份啮齿动物样本中再次检测到温州病毒,阳性率为10.41 %;但在龙泉地区采集的156份样本中均未发现温州病毒。分析病毒的全基因组序列发现其中4株病毒与已知的温州病毒有很高的同源性;而编号为Wencheng-Rn-288病毒株的S和L节段与已知病毒同源性分别为87.5%和91.6%,在进化树上为一独立分支,为温州病毒的新亚型。

结论

温州病毒在温州地区啮齿动物中有较高的流行率,且呈多样性。鉴于在柬埔寨已发现温州病毒能引起人呼吸道疾病,因此我国应加强温州病毒的监测。

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