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目的：对云南不同片区及不同类型的鼠疫菌株进行基因分型。方法：采用脉冲场电泳（PFGE）对菌株进行分析。结果：1．云南省鼠疫菌株被分为5个型，所有鼠疫菌株在680kb和330kb有两条共同的带；2．大部分家鼠鼠疫具有一致图谱；3．云南家、野两型鼠疫菌的脉冲场电泳图谱存在差异。结论：脉冲场电泳分析可用于云南鼠疫分子流行病学研究。