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采用均匀设计方法,对影响兴安落叶松ISSR—PCR体系的MgCl2、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板5个组分的浓度进行了u16(4^5)和u12(3^5)两轮优化,建立了适合于兴安落叶松的ISSR—PCR反应体系。该优化的20p.L反应体系包含MgCb3.0mmol/L、dNTPs0.15mmol/L、引物0.5ttmol/L、TaqDNA聚合酶1.0U、模板20ng/20μL。并进一步进行梯度退火试验,找到了最适的兴安落叶松ISSR退火温度为56.5℃。利用所确立的体系对部分兴安落叶松种质进行