【摘 要】
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为探究湖北半夏(Pinellia ternate)内生细菌的多样性、丰度及菌群功能,随机采集半夏植株样品,提取内生细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得16S rDNA V3～V4片段.采用IlluminaMiSeq高通量测序技术分析半夏植株中的内生细菌菌群结构,共获得有效序列39537条和用于物种分类的OTU数681条,包括6门、10纲、23目、29科、45属、26种的细菌.菌落多样性分析表明,湖北半夏内生细菌在门水平上,优势菌群为Proteobacteria,科水平上,Mitochondria和Pseu
【机 构】
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湖北省农业科学院中药材研究所,湖北 恩施 445000
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为探究湖北半夏(Pinellia ternate)内生细菌的多样性、丰度及菌群功能,随机采集半夏植株样品,提取内生细菌基因组DNA,通过PCR扩增获得16S rDNA V3～V4片段.采用IlluminaMiSeq高通量测序技术分析半夏植株中的内生细菌菌群结构,共获得有效序列39537条和用于物种分类的OTU数681条,包括6门、10纲、23目、29科、45属、26种的细菌.菌落多样性分析表明,湖北半夏内生细菌在门水平上,优势菌群为Proteobacteria,科水平上,Mitochondria和Pseudomonadaceae为优势菌群.功能预测结果表明,湖北半夏内生细菌编码的大多数基因与代谢相关,其次是基因信息处理、环境信息处理.
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