【摘 要】
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C2H2型转录因子在植物生长发育及次生代谢调控中发挥重要作用,本文利用生物信息学从基因组层面鉴定大麻(Cannabis sativa L.) C2H2基因家族成员,基于大麻基因组数据及转录组
【机 构】
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黑龙江中医药大学药学院,黑龙江哈尔滨150040;中国中医科学院中药研究所,北京100700
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C2H2型转录因子在植物生长发育及次生代谢调控中发挥重要作用,本文利用生物信息学从基因组层面鉴定大麻(Cannabis sativa L.) C2H2基因家族成员,基于大麻基因组数据及转录组数据,使用TBtools、MEGA软件以及NCBI、PlantTFDB、ExPASy、HMMSCAN、MEME、WoLFPSORT、PlantCARE等在线网站对其基因信息、染色体定位、进化关系、保守基序、共线性关系等进行分析.结果 显示,大麻中含有30个C2H2型基因家族成员(CsC2H2-1～CsC2H2-30),分布在大麻的9条染色体上,氨基酸大小介于138～635个氨基酸,理论等电点介于5.85～9.52,蛋白质分子质量介于15909.48～68445.53 Da.转录组结果分析显示,CsC2H2在大麻Diku品种的雌花、苞片、叶、茎及不同品种雌花中表达量均存在差异.实时荧光定量PCR结果验证了CsC2H2-1、CsC2H2-5、CsC2H2-19在Diku品种的雌花及苞片中表达显著,为深入研究C2H2基因家族功能及大麻优质品种的选育提供理论参考.
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