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电子显微镜在病理学中的应用较为广泛,并不断开拓着病理学的新领域。主要表现在从细胞、亚细胞的形态结构上阐明疾病的发生、发展及转归规律,丰富了传统病理学的知识;通过对亚细胞结构和病原体的观察,可诊断肿瘤疾病、肾小球疾病与其他一些细菌、病毒和寄生虫疾病。近几十年来分子生物学和免疫组织化学的迅速发展,为疾病的诊断提供了许多新的手段。但随着电镜技术的不断改良和与其他技术的紧密结合,电镜在病理学中的应用将更加广泛。