【摘 要】
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目的 利用染色质开放性测序技术(ATAC-seq)探讨叶酸缺乏对小鼠胚胎干细胞(mESC)全基因组染色质结构影响特征。方法 使用4mg/ml浓度的正常叶酸培养基培养mESC24h作为正常对照
【机 构】
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中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院,上海天昊生物,首都儿科研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金青年科学基金项目(81801453),北京市自然科学基金面上项目(7192161).
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目的 利用染色质开放性测序技术(ATAC-seq)探讨叶酸缺乏对小鼠胚胎干细胞(mESC)全基因组染色质结构影响特征。方法 使用4mg/ml浓度的正常叶酸培养基培养mESC24h作为正常对照组,使用终浓度为0.12μM的叶酸代谢障碍药物甲氨蝶呤(MTX)处理mESC24h作为MTX实验组,分别行ATAC-seq,获得胚胎早期全基因组染色质开放图谱。进行正常对照组及MTX实验组染色质开放区域数量、开放区域涉及基因功能及通路分析比较。结果 确立转座酶Tn57.5U消化正常对照组mESC,Tn55U消化MTX实
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