【摘 要】
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目的 分析阿尔茨海默病(AD)患者外周血环状RNA(circRNA)的差异表达谱,并预测其下游微小RNA(miRNA)靶点和亲本基因的生物学功能.方法 采用基因芯片技术分析3例AD患者(AD组)和3例健康体检者(正常对照组)外周血中circRNA的表达谱,筛选出2个组差异表达的circRNA,并进行生物信息学预测.选取其中2个差异表达的circRNA,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)在30例AD患者和22名正常对照者中进行独立验证.结果 筛选出144个AD患者与正常对照者之间存在差异表达(倍
【机 构】
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上海交通大学医学院附属精神卫生中心检验科,上海 200030
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目的 分析阿尔茨海默病(AD)患者外周血环状RNA(circRNA)的差异表达谱,并预测其下游微小RNA(miRNA)靶点和亲本基因的生物学功能.方法 采用基因芯片技术分析3例AD患者(AD组)和3例健康体检者(正常对照组)外周血中circRNA的表达谱,筛选出2个组差异表达的circRNA,并进行生物信息学预测.选取其中2个差异表达的circRNA,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)在30例AD患者和22名正常对照者中进行独立验证.结果 筛选出144个AD患者与正常对照者之间存在差异表达(倍数改变>1.5且P<0.05)的circRNA,表达上调和表达下调各72个.基因本体论(GO)富集分析结果显示,差异表达的circRNA的亲本基因主要涉及生殖过程、丝裂原活化蛋白激酶级联反应、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等生物学过程;京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析结果显示,差异表达的circRNA的亲本基因主要参与炎症性肠病、血管内皮生长因子(VEGF)、内吞作用、IgG Fc段γ受体(FcγR)介导的吞噬作用等信号通路.选取表达上调、下调的circRNA各1个(hsa_circ_0018905和hsa_circ_0024825)进行验证.RT-qPCR结果显示,AD组hsa_circ_0018905相对表达量显著高于正常对照组(P<0.05),hsa_circ_0024825相对表达量显著低于正常对照组(P<0.01),与基因芯片结果一致.结论 AD患者外周血存在差异表达的circRNA,部分差异表达的circRNA可能通过“miRNA海绵”作用参与AD的发生、发展.
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