结直肠癌组织表达谱芯片的生物信息学分析

来源 :中国现代普通外科进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户:feiwu111
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目的:探究结直肠癌发生发展的分子机制,并寻找结直肠癌早期诊断及预后的生物标志物。方法:从GEO数据库中选取结直肠癌表达谱芯片,利用R语言中limma函数进行差异表达分析,获取差异表达基因,使用DAVID6.7将差异表达基因进行KEGG信号通路分析,使用GEPIA在线工具查看差异基因在TCGA-COAD样本中的表达并绘制Kaplan-Meier生存曲线(OS)。结果:在3个表达谱芯片的差异表达分析结果中,有148个相同基因,提示这些基因与结直肠癌的发生发展具有密切关系,KEGG信号通路分析显示,结直肠癌组织
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