间隔子修饰引物对扩增产物电泳行为的作用初探

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目的:初步研究利用C3Spacer间隔子修饰引物对扩增产物电泳行为的影响及作用.方法:选取1个常用短串联重复序列(STR)位点,利用间隔子修饰该位点荧光标记引物,以DNA标准物质为模板进行PCR扩增,记录相应扩增产物DNA片段长度,进行修饰与长度变化的相关性分析.结果:选取STR位点D13S317,分别利用TTTTC3Spa-cerC3Spacer、TTTTC3Spacer、TTTT修饰ROX标记引物,相应扩增产物长度为182.67±0.05、182.19±0.11和181.6±0.19bp,未进行修饰的对照组引物扩增产物长度为177.09±0.15 bp,产物DNA片段长度随不同修饰基团的修饰发生规律性变化.结论:发现了一种修饰基团,用该基团修饰引物后,可在体外通过PCR反应改变扩增产物等位基因片段的大小,从而在不改变特异性引物信息的前提下使产物发生规律性位移,修饰基团与DNA片段大小呈内在相关性.
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