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目前高校科研项目存在与财务管理不衔接、项目预算编制不科学、预算执行不严格、绩效管理不系统等问题,原因是高校科研项目管理体制尚未理顺、项目预算管理意识不强、高校科研管理行政化和短期化色彩较浓。为此,建议完善高校科研项目管理体制,推动高校去行政化,同时进一步严格科研项目预算管理,建立完善科研项目绩效评价体系并推动其与预算管理的紧密结合。