龙眼UGT家族全基因组鉴定、功能预测及表达模式

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植物中糖基转移酶(UDP-glycosyltransferases,UGTs)糖化各种植物激素和代谢物以应对生物和非生物胁迫.对龙眼UGTs (DIUGTs)家族进行全基因组鉴定,对各成员理化性质、系统发育进化树、基因结构、染色体定位、保守基序、全基因组共线性进行预测分析,并结合转录组对DIUGTs在龙眼体胚发育胚性愈伤组织(EC)、不完全胚性紧实结构(ICpEC)和球形胚(GE)3个阶段的表达模式进行分析.结果 显示,DIUGTs家族共有167个成员.系统发育进化树分析发现这些成员分布于15个组中.蛋白保守基序分析发现所有成员均包含保守motif 1 (PSPG-box)且同组成员的motif分布高度相似.对DIUGTs家族成员的基因结构进行分析,发现其内含子数目在0-4之间.启动子顺式作用元件分析发现,各成员启动子区包含众多响应生物与非生物胁迫的作用元件,如光、温、激素等.染色体定位分析发现DIUGTs家族成员分布在14条染色体上,33个成员定位在chr14.对DIUG Ts在EC-ICpEC-GE阶段的表达模式分析发现共138 (83%)个成员在3个阶段检测到表达量,其中7个成员在EC-ICpEC-GE阶段呈持续上调表达.本研究通过预测分析发现DIUGTs家族成员具备功能多样性,可能在龙眼应对胁迫、细胞代谢及体胚发育过程中发挥作用,结果可为UGT关键基因的进一步筛选和表征提供理论依据.
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