辐照后非小细胞肺癌差异表达基因的生物信息学分析

• 作 者: 刘小强 马得勋 刘书锋
• 机 构: 青岛大学基础医学院特种医学系,海军第九七一医院涉核人员治疗科,海军青岛特勤疗养中心
• 出 处: 辐射研究与辐射工艺学报
• 发表日期: 2021年1期
• 关键词: 辐射 非小细胞肺癌 差异基因 生物信息学 Radiation Non-small cell lung cancer Differentially express
• 基金项目: 军队后勤计划项目(CJN15J001)资助

为了探讨辐射对非小细胞肺癌(NSCLC)lncRNA基因表达的影响,我们从GEO数据库中检索获得非小细胞肺癌辐照反应后Y染色体lncRNA基因表达谱数据芯片“GSE147708”,并进行多个在线数据库分析。利用GEO2R筛选差异表达基因;DAVID在线工具进行GO和KEGG富集分析;String在线网站构建蛋白互作网络,然后利用Cytoscape软件获取核心基因;通过GEPIA在线工具结合TCGA数据进行预后价值分析。共筛选获得上调表达基因23个,下调表达基因28个,通过构建蛋白网络获得了前20个核心基因