【摘 要】
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目的:探讨与激素性股骨头坏死(SONFH)相关的潜在关键基因,为进一步研究SONFH提供有效的生物学信息.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE74089和GSE123568的基因表达谱.使用Limma软件包鉴定差异表达基因(DEGs).基于String数据库对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行分析,并对DEGs进行功能富集分析.构建miRNA-mRNA相互作用的调控网络.在人骨髓间充质干细胞(BMSCs)中转染miR-140-5p的模拟物和抑制剂以验证其对细胞的影响.结果:从GSE7408
【机 构】
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新疆医科大学第五附属医院骨一科,乌鲁木齐830011
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目的:探讨与激素性股骨头坏死(SONFH)相关的潜在关键基因,为进一步研究SONFH提供有效的生物学信息.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE74089和GSE123568的基因表达谱.使用Limma软件包鉴定差异表达基因(DEGs).基于String数据库对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行分析,并对DEGs进行功能富集分析.构建miRNA-mRNA相互作用的调控网络.在人骨髓间充质干细胞(BMSCs)中转染miR-140-5p的模拟物和抑制剂以验证其对细胞的影响.结果:从GSE74089中筛选出569个DEGs.通过PPI网络识别364个DEGs具有互作关系.富集分析发现DEGs主要参与细胞外基质和细胞黏附分子等生物功能和信号通路.通过与GSE123568的DEGs交集分析识别出8个共同DEGs,利用受试者操作特征(ROC)曲线进一步识别SLC2A1、VCAN和FRY的临床诊断能力.通过定量聚合酶链反应验证了SLC2A1、VCAN和FRY在甲泼尼龙处理的BMSCs中的表达情况.预测分析结果中miR-140-5p靶向调控SLC2A1,并通过细胞实验验证了靶向调控关系.结论:SLC2A1、VCAN和FRY可能是SONFH的潜在生物标志物.miR-140-5p可能靶向SLC2A1调控HIF-1信号影响血管生成,并与SONFH的进展密切相关.
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