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本文以鸭茅基因组DNA为模板，利用小麦SSR引物对鸭茅SSR反应体系中的一些重要参数进行摸索和优化实验，建立了一套鸭茅SSR分子标记的最优化反应体系，在15μl体系中，最终浓度或量：Mg^2＋为2．5mm／L、dNTP为400μmol／L、Tax／酶为1.0U、引物浓度为2．0～2．5μpmol／L、模板NDA量为60～80ng。同时成功的筛选出20对能较好的应用于鸭茅种质资源遗传多样性研究的SSR引物，可用于鸭茅SSR标记的进一步研究。