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人们普遍认为,食用可发酵纤维可以改善机体代谢并维持健康。部分原因是通过促进互惠微生物和增加远端肠道中有益代谢物的产生来实现。然而,在人上的研究报告称,在食用相同纤维的个体中,观察到的益处存在差异。有几个因素可能导致了这种变异,包括宿主遗传和肠道微生物的差异。我们假设,肠道微生物对膳食纤维的代谢是调节膳食纤维影响宿主的一个重要的差异因子。我们采用了具有相同遗传背景的小鼠,使他们接受两个不同的复杂肠道微生物群落,同时暴露在四种等热量的饮食中。配方中分别含有不同的纤维来源:（Ⅰ）纤维素,（Ⅱ）菊粉,（Ⅲ）果胶,（Ⅳ）5种可发酵纤维（混合纤维）。肠道微生物组分析表明,每一个移植的群落都保留了一个核心的共同分类群,使其区别于其他群落。但在不同的饮食处理中,每一个群落的丰富度和细菌分类群的丰富度都有所不同。宿主表观遗传学、转录和代谢组学分析揭示了在这两个群落中定居的动物之间与饮食有关的差异,包括氨基酸和脂质途径的变化,这些变化与不同的健康结果相关。本研究表明肠道微生物菌群的个体间差异与膳食纤维对宿主代谢表型的不同影响有因果关系,并表明一刀切补充纤维以促进健康的方法不太可能在个体之间引起一致的影响。总体而言,提出的结果强调了微生物-饮食相互作用对宿主代谢的重要性,并表明肠道微生物调节膳食纤维的功效。