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对玉米抗病基因SSR标记的分析表明，在黄早四、4个黄早四衍生系和衍生系配制的4个杂交种中都存在矮花叶病抗性基因mdm／（t）与玉米茎腐病抗性基因Rfg1，但不具有茎腐病抗性基因Rpil。鲁单981具有南方锈病抗性基因RppQ，其余8个材料都不含该基因。对小斑病抗性基因STS标记的扩增结果显示，9个材料具有大小相同的带型，序列分析显示黄早四具有抗性基因rhm。SSR标记和STS标记分析结果同田间抗性相符合，两种分子标记可有效地用于玉米抗性基因的遗传传递分析。