基于RNA-Seq技术的蜡蚧轮枝菌转录组分析

• 作 者: 张某 高熹 郝凯强 谭清 庞仁乙 兰明先 李召波 夏涛 鲁武
• 机 构: 云南农业大学植物保护学院
• 出 处: 生物安全学报
• 发表日期: 2017年3期
• 关键词: 蜡蚧轮枝菌 RNA-SEQ 转录组 Verticillium lecanii RNA-Seq transcriptome
• 基金项目: 国家自然科学基金项目（31160379）

[目的]蜡蚧轮枝菌是一种防治植物病原物和害虫的生防菌，弄清其致病的分子基础具有重要的意义。[方法]利用Illumina HiSeq技术测序蜡蚧轮枝菌的cDNA文库，并进行RNA-Seq序列拼接和功能注释。[结果]共获得1634670条高品质reads，碱基GC含量48.50%。14856条Unigene经组装拼接后，在Nr、Swiss-Prot、COG和KEGG数据库中分别比对得到1467、9379、6518和4188条Unigenes。采用GO分类工具将21403条Unigenes分成24个功能组，主要