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从2013年9月到2015年6月，方舟子与崔永元围绕“转基因食品是否安全”展开论战。2015年6月25日，一审法院判决崔永元、方舟子删除法院认定的侵权微博，双方在指定媒体上向对方道歉，崔永元赔偿方舟子精神损害抚慰金3万元及诉讼合理支出1．5万元，方舟子赔偿崔永元精神损害抚慰金2．5万元及诉讼合理支出2万元。本文以方舟子与崔永元“转基因论战”为例，探讨网络舆论冲突的利弊及调控路径。