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采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术，对东北地区杂草稻生态型以及普通水稻共15个样品进行亲缘关系的分析。所分析的10个随机引物共扩增出了93条DNA片段，其中多态性条带为36条，多态性比例为38、71％，利用93个RAPD标记，在MEGA2．1软件中，计算遗传距离，建立UPGMA聚类图。结果表明：RAPD分子标记可以将杂草稻与普通稻、杂草稻不同生态型之间分开；杂草稻之间形态相似、地理分布相近的物种聚类在一起。