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对抗生素耐药性的增加导致各地区间致病原的敏感性有显著差异；结果，不同医学中心采用不同的经验治疗方案.对发热伴中性粒细胞减少症患者，现在一些权威建议采用广谱抗生素单药治疗以代替多种药物联合治疗；这一方法仍存在争议.在死亡风险较低的免疫抑制患者，全身性感染可考虑口服药物治疗.为支持低风险性饮食，在严重免疫抑制患者中使用无菌食物的方法已基本被放弃