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肝脏是一个独特器官，其血窦的有孔内皮细胞接触大量的抗原物质，包括食物蛋白和肝脏的代谢产物及致病病原菌的产物。在抗原及抗原递呈作用下，肝脏可以引起免疫耐受或炎症的发生，也可以有效地调节正在进行中的免疫反应。肝脏含有天然免疫反应细胞，例如NK细胞及NKT细胞，这些细胞选择性地富集在肝脏，在抗御病原微生物侵袭的第一线免疫反应中发挥重要作用。