【摘 要】
：
应用Pharm Mapper在线数据库预测虾青素(astaxanthin,ASX)的作用靶点,并应用OMIM、TTD等在线数据库获取乳腺癌的作用靶点;将ASX的靶点与乳腺癌的疾病靶点取交集得到ASX抑制乳腺癌的靶点,通过Cytoscape 3.7.1软件构建作用靶点的蛋白相互作用网络图筛选关键靶点;利用GO和KEGG数据库对所有作用靶点进行基因功能富集分析和通路富集分析,以确定其关键作用通路,探讨ASX抑制乳腺癌的作用机制。采用MTT法检测ASX对乳腺癌4T1细胞增殖的影响,通过Western Blot法
【机 构】
：
内蒙古医科大学分子病理实验室慢性病分子流行病实验室
【基金项目】
：
国家自然科学基金项目(81960603),内蒙古自治区自然科学基金项目(2020MS08136,2020BS08015),内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZZ18100),内蒙古医科大学科技百万工程项目(YKD2017KJBW007),内蒙古医科大学青年创新项目(YKD2018QNCX021)。
论文部分内容阅读
应用Pharm Mapper在线数据库预测虾青素(astaxanthin,ASX)的作用靶点,并应用OMIM、TTD等在线数据库获取乳腺癌的作用靶点;将ASX的靶点与乳腺癌的疾病靶点取交集得到ASX抑制乳腺癌的靶点,通过Cytoscape 3.7.1软件构建作用靶点的蛋白相互作用网络图筛选关键靶点;利用GO和KEGG数据库对所有作用靶点进行基因功能富集分析和通路富集分析,以确定其关键作用通路,探讨ASX抑制乳腺癌的作用机制。采用MTT法检测ASX对乳腺癌4T1细胞增殖的影响,通过Western Blot法
其他文献
目的:探究CTRP3在糖氧剥夺/再灌注(OGD/R)诱导的心肌细胞损伤中的作用及其可能的作用机制。方法:体外培养大鼠心肌细胞H9c2,OGD/R诱导H9c2细胞损伤。qRT-PCR法检测细胞CTRP3、SIRT1和FOXO3a mRNA表达;Western blot检测细胞CTRP3、SIRT1、FOXO3a、Bax、Bcl-2和cleaved caspase-3蛋白表达,CCK-8检测细胞存活,流式细胞术检测细胞凋亡,检测细胞CK-MB、cTnI、SOD和MDA活性、GSH-Px含量及ROS的产生。结果
为了明确不同基因型腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)是否具有生殖隔离及杂交后代的变异程度,选用1条3-4龄幼虫与5条雄虫,将不同基因型群体进行生物学杂交,对F1代数量、ITS-rDNA序列及其二级结构比对分析。结果表明,杂交产生F1代数量普遍较少,不同基因型杂交组合F1代线虫数量≤6条/处理,部分组合的后代仅为1条。因F1代数量较少,11个杂交组合中获得5个F1代群体的ITS-rDNA序列,不同基因型杂交F1代与其亲本ITS-rDNA序列均存在0-86 bp的碱基差异,且其二级结构
水稻潜根线虫病是江西省水稻生产上危害严重的病害之一。前期通过对水稻细尖潜根线虫侵染抗/感病水稻品种的根部组织进行比较转录组分析,筛选出差异表达上调基因OsRAI1。本研究克隆获得OsRAI1全长,通过蛋白结构预测、亚细胞定位对其功能进行分析,通过IPTG诱导,对OsRAI1蛋白表达条件进行了优化。结果表明,OsRAI1基因ORF全长1065 bp,编码354个氨基酸,属于bHLH转录因子家族。该蛋白为亲水性蛋白,分子量37.90 kD,pI值4.86,脂肪系数68.33,总平均亲水性(GRAVY)-0.4
芽胞杆菌是一类重要的植物病害生防因子。为挖掘防治蔬菜根结线虫的芽胞杆菌优良菌株,从根结线虫病抑制性土壤中分离到62株芽胞杆菌,测定不同菌株发酵滤液对二龄幼虫的致死作用和卵孵化的抑制作用初筛生防菌,然后利用室内盆栽试验测定生防菌株的防治效果,结果发现NB-04菌液灌根处理根结指数最低,防治效果达61.6%。进一步通过形态特征和16S rDNA序列比对,将NB-04菌株鉴定为甲基营养型芽胞杆菌Bacillus methylotrophicus。此外,测定了该菌株发酵滤液对根结线虫卵囊过氧化氢酶、乙酰胆碱酯酶和
规律成簇间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与其相关蛋白基因系统可通过限制基因的水平转移而有效防御噬菌体等外源
疣孢漆斑菌(Myrothecium verrucaria)ZW-2菌株对大豆孢囊线虫具有(Heterodera glycines)明显的杀线虫活性,为了确定该菌株的最优发酵条件以及代谢产物,采用4因素3水平的正交试验进行了发酵条件优化以及代谢组学分析。结果表明:菌株ZW-2以Czapek培养基为基础培养基,最佳培养温度为28℃,摇床转速为180 r/min,装瓶量为100 mL,培养基pH为8,最佳碳源和氮源为蔗糖和硝酸钠。经代谢组学分析,根据代谢物质荷比、精确分子量及一级碎片离子得分等信息共筛选出20种
人分泌型磷脂酶A2GIIE(Human secreted phospholipase A2GIIE,hGIIE)通过发挥酶催化作用,参与炎症反应和脂代谢过程.为了揭示hGIIE的底物选择机制,文中对hGIIE进行了定点突变
通过对不同微生物中乙烯合成酶(EFE)同源基因的筛选,成功获得了一种Neofusicoccum parvum(NpEFE)来源的高活性乙烯合成酶.以pET28a为载体成功实现了这种高活性efe基因在大肠
以水华常见优势种铜绿微囊藻为试验材料,研究不同浓度丁二酸、香草酸与肉桂酸这3种有机酸对铜绿微囊藻生长及光合色素的影响。结果表明:有机酸对铜绿微囊藻生长的抑制作用随着处理浓度的增加而增强,丁二酸、香草酸与肉桂酸对铜绿微囊藻的最大抑制率达到98.63%、48.06%和96.70%,抑制作用大小排序为肉桂酸>丁二酸>香草酸;丁二酸、香草酸及肉桂酸作用下,铜绿微囊藻叶绿素a含量、藻胆蛋白各组分均有一定损伤,且藻蓝蛋白与别藻蓝蛋白受损程度较藻红蛋白重。有机酸通过作用于藻类光合系统Ⅱ反应中心,抑制藻类光合
植物线虫是世界农业上危害最严重且最难防治的病原物之一,可以寄生多种植物,每年造成数十亿美元损失。生防菌可以激发植物的一些抗病基因表达,从而激活某些免疫途径,对植物线虫的侵染、发育产生抑制作用。这种特性使植物-生防菌-线虫三者构成全新的生物调控关系,成为植物免疫研究的新模型。非编码RNA是生物学领域热点研究内容,其可能参与了植物线虫和其他生物如生防微生物等调控植物免疫的反应。本文综述了miRNA、lncRNA和circRNA等在微生物、植物线虫与寄主互作过程中研究现状;阐述了miRNA作为新兴的基因表达转录