【摘 要】
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为研究青甘韭cpSSR序列的特征，本研究通过IlluminaNovaSep高通量测序技术对叶绿体基因组进行测序，使用MISAv1.0软件对叶绿体基因组微卫星进行搜索分析，Primer3软件对所获得的cpSSR序列进行聚合酶链式反应（PCR）引物设计。结果显示，在青甘韭153 509bp叶绿体基因组序列上共检测到255个SSR位点，平均每602bp出现一个cpSSR重复序列，共有6种类型，其中单碱基
【基金项目】
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青海省自然科学基金项目（2019-ZJ-984Q）资助；
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为研究青甘韭cpSSR序列的特征，本研究通过IlluminaNovaSep高通量测序技术对叶绿体基因组进行测序，使用MISAv1.0软件对叶绿体基因组微卫星进行搜索分析，Primer3软件对所获得的cpSSR序列进行聚合酶链式反应（PCR）引物设计。结果显示，在青甘韭153 509bp叶绿体基因组序列上共检测到255个SSR位点，平均每602bp出现一个cpSSR重复序列，共有6种类型，其中单碱基数量最多，占比67.42%，其次是三碱基（23.11%），六碱基最少，仅占0.38%。微卫星长度区间为8～25bp，主要在8～10bp（75.29%），其中长度在20bp及以上的有8个，说明青甘韭叶绿体基因组上的微卫星位点具有较高的多态性潜能。利用Primer3软件成功在251个cpSSR位点中共设计PCR引物753对。随机合成25对引物进行PCR，其中25对表现出有效扩增。对青甘韭cpSSR的分析，可以为SSR引物进一步筛选和遗传多样性研究提供信息。
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