基于重测序数据的湖羊产羔数性状全基因组关联分析

• 作 者: 谢锐 朱墨 童世锋 赵福平 刘杨
• 机 构: 南京农业大学动物科技学院,江苏南京 210095;农业农村部都市农业重点实验室,上海 200240;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193;南京农业大学动物科技学院,江苏南京 21009
• 出 处: 畜牧与兽医
• 发表日期: 2021年5期
• 关键词: 全基因组关联分析 产羔数 重测序 湖羊
• 基金项目: 农业农村部都市农业重点实验室开放课题(UA201909);国家自然科学基金面上项目(31572357)

旨在利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)挖掘与湖羊繁殖性状相关的候选基因,解析湖羊高繁殖性状的遗传基础.本研究利用206只湖羊母羊的全基因二代重测序数据(群体平均测序深度为6x),结合第一胎产羔数、第二胎产羔数及2胎平均产羔数的表型性状,基于混合线性模型,并利用质控后的1 604 526个SNP标记进行全基因组关联分析.结果:未发现影响湖羊第一胎产羔数、第二胎产羔数和2胎平均产羔数的显著SNP位点,这可能与羊的繁殖性状是一种低遗传力性状、且受微效多基因控制有关.此外表明,本研究所使用的混合线性模型被验证是可信的.