三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析

• 作 者: 宋来鹏 刘萍 李健 刘振辉
• 机 构: 中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国海洋大学海洋生命学院
• 出 处: 中国水产科学
• 发表日期: 2008年5期
• 关键词: 三疣梭子蟹 基因组 微卫星 Portunus trituberculatus microsatellite genome

对三疣梭子蟹（Portunustrituberculatus）部分基因组DNA文库测序，获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列，从中找到微卫星重复序列（1～6bp重复）697个。统计微卫星重复类型，以两碱基重复数目最多，为445个，占微卫星序列总数目的63．84％；其次是三碱基重复152个，占21．81％；再次分别是单碱基重复45个，占6．46％；四碱基重复31个，占4．45％；五碱基重复14个，占2．01％；六碱基重复10个，占1．43％。在单碱基重复类型中，重复拷贝类别全部为A；两碱基重复