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【目的】研究转基因抗虫棉叶围细菌的种群动态变化，并鉴定主要的细菌种群。【方法】采用常规培养的方法与RIsA法相结合，分析转基因抗虫棉花33B、SGK321和GK12、受体棉花33、石远321和泗棉3号的叶围细菌在整个生育期的种群动态变化，并对主要细菌种群的ITS序列进行克隆测序，与数据库的序列进行比对鉴定细菌。【结果】6个棉花品种的叶围细菌的数量和群落多样性指数随着时间的变化，同一棉花品种不同采样时间之间差异显著，而同一采样时间抗虫棉和对应的受体棉间的差异较小。用RISA法分析棉花叶围细菌群落结构，能够得