【摘 要】
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目的 评价间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)两种分型方法在西藏地区结核病分子流行病学中的应用.方法 收集西藏地区结核分枝杆菌(M
【机 构】
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拉萨,西藏自治区疾病预防控制中心,Institute of Genetics and Microbiology,董海燕,成都
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目的 评价间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)两种分型方法在西藏地区结核病分子流行病学中的应用.方法 收集西藏地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)临床分离株,应用Spoligotyping及MLVA两种分型方法进行比较分析.结果 共在西藏地区收集剑216株结核分枝杆菌临床分离株,采用Spoligotyping分型方法,216株菌可分为3个基因群13种基因型,其中最大的1个基因群即北京家族(Beijing family)含有195株菌,占90.28%.北京家族菌株中,有BCG接种史者占45.64%(89/195),无BCG接种史者占54.36%(106/1195),两者间的差异无统计学意义(χ2=0.059,P>0.05).采用MLVA分型方法,216株菌可分成19个基因群108种基因型,其中80种基因型只有1株菌,占37.03%(80/216),另有136株菌表现出28种基因型,成簇数为28,占62.96%(136/216).在20个VNTR位点的等位基因多态性发现Miru31位点的多态性最高,多态性指数(h)达到0.77,而Mtub29、Mtub12位点的多态性较差,都低于0.05.其中Mtub02位点可鉴别北京家族和非北京家族,它鉴别的北京家族与Spoligotyping鉴别的北京家族符合率达到100%.结论 西藏地区结核分枝杆菌具有明显的接引多态性,其主要流行型为北京家族.北京家族菌株与BCG接种无相关性.应用Spoligotyping和MLVA两种分型方法进行结核病流行病学研究,将提高结核病的流行病学调查和病原学监测效果.
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