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首都医科大学附属北京中医医院消化中心是伴随北京中医医院1956年成立而设立的院内重点科室，是首都医科大学中医、中西医结合消化专业研究生的主要培养丛地，现为国家中医药管理局中医消化重点学科、北京市中西医结合消化重点专科、北京市中医消化特色诊疗中心建设单位、中华中医药学会内科脾胃病委员会挂靠和牵头单位。