毛竹长末端重复序列反转录转座子的全基因组特征及进化分析

来源 :浙江农林大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hbb88191312
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【目的】研究毛竹Phyllostachys edulis基因组中的长末端重复序列反转录转座子(long terminal repeat retrotransposons, LTR-REs)的特征,为今后利用LTR反转录转座子对毛竹基因组的功能和对竹种资源遗传多样性的研究奠定基础。【方法】通过生物信息学方法,利用LTRharvest和RepeatMakser软件对第2版毛竹基因组中的LTR反转录转座子进行全面注释与分类,并对得到的LTR反转录转座子的分布特征、进化特性和插入时间进行分析。【结果】在毛竹基因组
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