恙虫病东方体Ot56蛋白序列生物信息学分析

• 作 者: 刘昌政 郭瑜琪 李小聪 周晓红 李华
• 机 构: 南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系
• 出 处: 热带医学杂志
• 发表日期: 2008年8期
• 关键词: 恙虫病东方体 Ot56蛋白 生物信息学 Orientia tsutsugamushi Ot56 protein bioinformation

目的分析恙虫病东方体Ot56蛋白序列中的变异区和保守区，为恙虫病的蛋白与核酸诊断提供参考。方法从Gen Bank获取目标序列，用Lasergene、MEGA、Vector NTI suite、Athe Port和NCBI Blast等工具进行分析。结果120条Ot56氨基酸序列的相似性为61.4％-100.0％，变异度为0.0～57．1；氨基酸的105-171、179～215、248～285、375～428和447～503区域为高变异区：膜外区200～400具有变异度高、抗原性强的特性。113条Ot56c