【摘 要】
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利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在斑马鱼中构建了可稳定遗传的生长抑素(somatostatin,SST)基因(sst1)突变体鱼系.通过比较6 dpf(days post fertilization,dpf)的sst1-/-突变体和野生型仔鱼转录组,发现sst1-/-突变体相关生化过程和信号通路发生了显著变化.相比野生型,sst1-/-突变体仔鱼中有354个基因显著上调,504个基因显著下调.GO(gene ontology)富集分析表明,大部分差异基因与氨基酸和蛋白质生物合成相关.KEGG(kyo
【机 构】
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上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心,上海 201306;CCMAR-Centre of Marine Sciences,University of the Algarve,Gambelas
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利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在斑马鱼中构建了可稳定遗传的生长抑素(somatostatin,SST)基因(sst1)突变体鱼系.通过比较6 dpf(days post fertilization,dpf)的sst1-/-突变体和野生型仔鱼转录组,发现sst1-/-突变体相关生化过程和信号通路发生了显著变化.相比野生型,sst1-/-突变体仔鱼中有354个基因显著上调,504个基因显著下调.GO(gene ontology)富集分析表明,大部分差异基因与氨基酸和蛋白质生物合成相关.KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集显示代谢通路、氨基酸合成、氨基酰基-tRNA合成、核糖体合成和rRNA加工相关通路表达增强.结果 表明,sst1-/-突变体蛋白质生物合成和代谢过程更加活跃.RT-qPCR验证结果显示,随机选取的10个基因mRNA表达变化趋势与转录组测序结果一致,说明转录组测序结果真实可靠.6月龄突变体体质量、体长和野生型相比并无显著差异.本研究结果为进一步挖掘生长抑素基因家族的潜在功能奠定基础.
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为研究混播制种模式下二系杂交小麦不同组合制种产量变异和产量构成因素的关系,以期为高制种产量杂交小麦组合的筛选提供科学依据.研究在混播制种模式下,以不育系S1和7个恢复系R1～R7为试验材料,调查穗数、穗粒数和千粒质量等产量构成因素以及抽穗期、花期和株高相关农艺性状,通过相关分析研究不同杂交小麦组合制种产量与产量构成因素的关系,并进一步分析穗粒数与亲本农艺性状的关系.结果表明,穗粒数与组合亲本的抽穗期差和花期相遇期显著相关;组合亲本的抽穗期差和花期相遇期与组合穗粒数均呈显著相关,是穗粒数变异的主要因素,而穗
研究旨在明确251份欧洲20世纪育成的冬小麦代表性品种对中国条锈菌的抗性水平以及所含的抗病基因,为拓宽抗源的遗传基础、培育抗条锈病小麦新品种以及抗源的合理利用提供依据.利用甘肃天水地区良好的自然诱发条件,连续2 a对251份欧洲冬小麦品种进行田间成株期抗病性鉴定,并通过分子标记对4个已知的抗条锈病基因(Yr10、Yr15、Yr18、Yr26)进行检测,以确定所筛选的抗病材料是否携带已知的抗病基因.结果表明,通过田间成株期鉴定,发现抗病的材料有141份,其中表现为免疫的45份、高抗的72份、中抗的24份,表
为探索小麦表皮蜡质合成机制及调控机制,研究以济麦22无蜡突变体和多蜡突变体抽穗期叶片为材料,采用转录组测序技术分析2种突变体中叶片基因表达情况,以筛选出差异表达基因,并对差异表达基因进行KEGG蜡质功能注释和通路富集分析.结果显示,在2种突变体叶片中共获得40.63 Gb高质量基因数据,各样品中有效数据均达到9.63 Gb,Q30碱基百分比在94.22％以上,比对效率达到91％以上.2种突变体叶片中共检测到6840个差异表达基因,包括3181个上调基因和3659个下调基因.KEGG蜡质功能注释发现,差异基
为了探究豌豆黄化突变体形成机制,以豌豆黄化幼苗突变体(yl)和野生型植株(WT)为材料,对2份材料的叶片进行比较转录组分析.结果显示,利用高通量转录组测序技术分别从WT和yl中分别获得25599903、24806761条片段;通过对2份材料差异基因的筛选,共得到4423个差异表达基因(DEGs),其中,2449个上调表达,1974个下调表达;对其中9个相关基因进行了RT-qPCR验证,表达趋势与RNA-Seq结果一致.GO功能富集分析发现,差异基因广泛涉及生物合成与代谢等途径.对参与叶绿素合成和光合作用途
为明确引起大麦叶斑病的不同麦根腐平脐蠕孢菌(Bipolaris sorokiniana)的致病性差异,通过大麦叶斑病苗期侵染型分级标准测定弱致病性麦根腐平脐蠕孢菌ND-85和强致病性麦根腐平脐蠕孢菌ND-87的致病性,进一步采用非靶向代谢组学与多元统计分析方法,比较了2种不同麦根腐平脐蠕孢菌菌株的代谢差异.主成分分析(PCA)结果显示,菌株ND-85和ND-87间分散明显,通过正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)共筛选出726种重叠的差异代谢产物,其中,有458种差异代谢产物下调,268种差异代谢产
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为探讨谷子的耐低氮能力,以晋谷21诱变获得的超早熟突变体Xiaomi为研究材料,采用水培法,对谷子苗期低氮胁迫下的表型、光合性能及抗氧化相关酶等生理指标进行分析评价.结果表明,低氮胁迫下谷子总根长、侧根数量、根表面积、根体积和根冠比增加,旗叶长、宽减小,老叶早衰发黄,株高、茎粗、叶厚及总氮含量降低;叶绿素含量显著降低,气孔导度及净光合速率下降,同时随着胁迫时间的增加,叶片荧光参数PI abs、φEo、φRo、ETo/CSm极显著降低;此外,低氮胁迫下谷子叶片及根系丙二醛(MDA)含量分别表现为增加、降低的
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SBP(Squamosa promoter binding protein)是植物中一类特有的转录因子,在调控株型建成、开花、产量、激素信号转导、逆境响应等方面发挥重要作用.为探究谷子SBP家族基因的表达模式,利用生物信息学和荧光实时定量PCR,对19个SiSBPs在不同组织器官中的表达模式进行了分析,并对其启动子顺式作用元件进行预测,进一步分析了7个SiSBPs对3种植物激素和3种逆境胁迫的响应规律;同时,利用psRNATarget server对miR156和miR529的靶基因结合位点进行了预测.结
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