黄瓜花叶病毒分子变异分析

• 作 者: 杨洪一 孙立娜 张杰
• 机 构: 东北农业大学园艺学院
• 出 处: 黑龙江农业科学
• 发表日期: 2011年1期
• 关键词: 黄瓜花叶病毒 重组 系统进化分析 Cucumber mosaic virus recombination phylogenetic analysis
• 基金项目: 黑龙江省教育厅科研资助项目（11541033）, 中国博士后科学基金资助项目（20080430877,200902369）, 黑龙江省博士后基金资助项目（LBH-Z08252）

利用不同生物信息学软件及算法对黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus,CMV）的分子变异进行分析。结果表明：不同CMV分离物外壳蛋白基因的核苷酸序列同源性为76.1%~99.2%。系统进化分析显示不同CMV分离物分为3个大的类群,不同分离物呈现一定的地域相关性,未见明显寄主相关性。重组分析显示澳大利亚分离物243可能为中国分离物PE和韩国分离物Ca-p1的重组体。