基于粗糙集的基因信号属性约简

• 作 者: 刘富 张潇 侯涛 刘云
• 机 构: 吉林大学通信工程学院
• 出 处: 吉林大学学报(工学版)
• 发表日期: 2015年2期
• 关键词: 计算机应用 属性约简 粗糙集 k-mer频率 computer applicationattributes reductionrough setk-mer fr

为了解决k-mer频率在对DNA片段进行识别的过程中耗时长、效率低等问题,采用粗糙集的属性约简理论对DNA片段中提取的k-mer数字特征进行有效的约简优化,并对30个微生物菌株的全基因组进行了信号约简实验,结果证明本文所用方法能将原始的高维基因信号约简掉72.27%,准确率提升0.62%,运行时间缩短73.3%。