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明清时期福建地区疫病多发,对其流行情况的研究是中国古代疫情研究的重要内容.从时间维度、空间维度、四时季节、疫病种类以及致疫因素等多角度对明清福建南北瘟疫情况进行对比研究,可直观地了解瘟疫曾给民众带来的危害和影响.分析明清时期闽北、闽南地区不同的疫情特点及自然、社会双重因素对疫情的影响,并对疫病发生原因、时空分布的规律、人类文化行为之影响进行深入探讨,以期对今后的疫病防治策略产生一定的启示意义.