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针对现有凝胶图像间蛋白点匹配方法在选择特征时,没有直观和统一标准的问题,本文提出了基于相似度图的蛋白点特征分析方法。首先给出相似度图的定义和生成方法;其次利用相似度图法分析坐标相似度、形状上下文相似度和形态参数相似度等5种常用特征的特点及优劣;最后根据特征分析结果提出一种多特征综合利用的乘积法,相比均值法具有更好的匹配效果。为验证相似度图和多特征综合乘积法的有效性,开展了多种图源的凝胶图像蛋白点匹配实验,结果表明,相似度图能够直观、有效地反映蛋白点特征的匹配性能,对多特征的选择和综合利用具有很好的指