【摘 要】
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目的用生物信息学技术预测布鲁氏菌Omp10蛋白的抗原表位,寻找布鲁氏菌Omp10的优势表位。方法利用IEDB在线软件、DNAStar软件、Pro Pred MHC Class-ⅡBinding Peptide Predict
【机 构】
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新疆医科大学第一附属医院输血科,新疆医科大学第一附属医院生殖助孕中心,新疆医科大学第一附属医院检验科,新疆医科大学基础医学院免疫学教研室,
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目的用生物信息学技术预测布鲁氏菌Omp10蛋白的抗原表位,寻找布鲁氏菌Omp10的优势表位。方法利用IEDB在线软件、DNAStar软件、Pro Pred MHC Class-ⅡBinding Peptide Prediction Server软件和SYFPEITHI软件,通过分子结构、亲水性、柔韧性、表面可及性以及抗原指数等在线分析Omp10蛋白的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位。结果布鲁氏菌Omp10蛋白B细胞抗原表位有4个,为26-34、65-75、97-102和115-120氨基酸残基。Omp10蛋白T细胞抗原表位有6个,为64-79、72-87、104-119、6-21、9-24和78-93氨基酸残基。结论通过综合分析布鲁氏菌Omp10蛋白有4个B细胞抗原表位和6个T细胞抗原表位,为进一步筛选具有一定抗原保护性和免疫原性的优势表位和多价疫苗构建奠定了基础。
OBJECTIVE: To predict the epitope of Brucella Omp10 by bioinformatics and to find the dominant epitope of Brucella Omp10. Methods The secondary structure of Omp10 protein was analyzed online using IEDB online software, DNAStar software, Pro Pred MHC Class-Ⅱ Binding Peptide Prediction Server software and SYFPEITHI software by molecular structure, hydrophilicity, flexibility, surface accessibility and antigen index , B cell epitopes and T cell epitopes. Results Brucella Omp10 protein B cell epitopes 4, 26-34,65-75,97-102 and 115-120 amino acid residues. Six of Omp10 protein T cell epitopes are 64-79, 72-87, 104-119, 6-21, 9-24 and 78-93 amino acid residues. Conclusion A total of 4 B-cell antigen epitopes and 6 T-cell epitopes were identified by a comprehensive analysis of Brucella Omp10 protein, which laid the foundation for further screening of epitopes and multivalent vaccines that have certain antigenic protection and immunogenicity basis.
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