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预算管理是科研院所管理中一项重要的基础工作，科研单位作为完成预算单位经济目标的主要责任主体，其预算管理具有重要的意义。20世纪90年代中期，我国科研院所事业单位全面启动了预算管理工作。通过多年预算管理工作的探索与实践，科研院所事业单位逐步形成了一套有效的预算管理机制。但仍存在不少问题，本文就如何加强科研院所的预算管理工作作一些分析。